修改后的农村土地承包法对于土地经营权的制度设计，主要包括几个方面：
一、在总则第9条中，提出了土地经营权的概念，同时也表达了整个制度设计的理论基础。这个理论基础就是承包方既可以自己经营，有也可以流转其承包地的土地经营权，由他人经营。流转承包地的土地经营权，就是由他人经营的一个实现方式。在第9条中作了一个基本的规定，出来了土地经营权的概念。
二、关于流转的方式。修改后的农村土地承包法第36条规定，承包方可以自主决定依法采取出租(转包)、入股或者其他的方式，向他人流转土地经营权，并向发包方备案。
三、关于土地经营权的登记。修改后的法律第41条规定“土地经营权流转期限为五年以上的，当事人可以向登记机构申请土地经营权登记，未经登记，不得对抗善意第三人”，关于登记的规定，同时在法律上也是一个关于土地经营权物权效力的表述。
四、关于土地经营权的融资担保，依照新修改后的法律第47条规定，一个方面，承包方可以用承包地的土地经营权向金融机构融资担保，就是承包方自己就可以用土地承包经营权向金融机构融资担保。另一方面，土地经营权流转的受让方，通过流转取得的土地经营权，经过承包方的书面同意并向发包方备案，也可以向金融机构融资担保。融资担保以后，就发生了担保物权的效力。当事人就可以向登记机构申请登记。作为担保物权人的金融机构，有权就土地经营权优先受偿。
（采晴整理）