实际中，土地确权是一个很复杂的过程，每个地方都有不同情况。“多出的土地”来源不同，本身的性质便存在差别，不同情况的处理方式也不太一样，主要有以下几种情况。
1、测量技术原因：
算算时间，二轮承包距今已有约20年。当时测量耕地面积的技术相对落后，很多地方都是拉着皮尺，估摸一下大概;另外随着时间推移，一些地方在地貌地形上发生变化。
这次土地确权，技术先进，精确度高，确定耕地“四至”可以精确到厘米。结果就是原来粗线条测量的隐形面积被显现出来，即实际测量的面积可能比原来测量的面积大得多。
处理方式以江苏省武进区为例：按实际面积确权颁证，确权证书上注明两次测量的面积。如果地块是种粮的，国家的粮食补贴还是按照二轮承包时确定的面积计算。
2、个人开荒问题：
现在很多农民除了自己的耕地外，还额外开荒一些土地用于种植农作物，原则上这种私自开垦行为是不合法的，所以对于开荒多出来的土地是不会给开荒者颁发土地确权证书的。
对于荒地的处理，需要通过全体村民集体协商，并上报给上级政府进行确权登记，村民个人是无权利获得荒地的确权的。不过多数地区在实际操作中，仍然由开垦的农民继续耕作，并没有收回超过面积的土地。
以安徽省滁州市为例
当地对于农民开垦出的河滩、荒地并不予确权发证，实际操作中依然由开垦的农民继续耕作。
3、开垦占用集体土地：
农民私自开垦占用的集体田间道路、沟渠等土地，属农村集体经济组织统一管理使用的建设用地，不能确定为农户家庭承包地进行确权登记颁证，这部分土地将被收回，恢复原貌。
4、抢种的集体机动地：
村组集体经组织依法预留的机动地，由集体统一经营管理，按照法定程序由村民会议审议同意后，可依法承包给农户。未经法定程序审议，农户私自抢种的集体机动地，对其承包经营权依法不予土地确权登记颁证，由集体收回统一经营管理。
5、农户故意隐瞒数据：
原本承包的土地面积就是4亩，但有些农民为了少交农业税，故意少报了1亩地数据，造成统计上的偏差，这1亩地就是人们常说的“黑地”。对于“黑地”，在土地确权时应计入确权面积。
如果面积出入不大，一般来说根据事实说明情况，依照实际面积依法确权颁证，登记时需要将前后两次的耕地面积都标注清楚。如果面积出入较大，将实施“有偿使用”或“退承包地”的办法，至于超出土地面积多和少的标准各地也有明确的规定，由各自村集体协商。
（采晴整理）