实践中产生无证房屋的原因有很多，最典型的有以下几种：
1、历史遗留无证房屋：应予补偿。
这类房屋建造时间都比较久远，根据当时的法律法规，房屋建造时并未要求取得规划许可等材料。在新的法律法规出台后，行政部门也未组织补办房屋所有权证明等材料，于是就出现了很大一批历史遗留性的无证房屋。这些历史遗留的无证房屋建造时法律法规不健全，甚至处于无法可依的状态。
如果在房屋征收中依据现行的相关法规之规定，以其不具备相关房产证明而认定其为违法建筑，进而不予以财产保护，是不符合法不溯及既往和信赖保护原则的。对于这类房屋，应由行政机关确权并补齐证件，认定为合法建筑，并给予足额补偿。
2、政府不作为或违法行政导致的无证房屋：应予补偿。
实践中还有一些无证房屋的形成是由于行政机关的原因造成的，例如某些政府部门怠于行使职权，该审批的不审批，该管制的不管制。
在此情况下，必须考虑到行政机关的过错和违法性，而不应将不利后果都由被征收人承担。如果完全是由政府原因导致的证件不全，则应该由政府承担后果，依法为被征收人补齐证件，依法全额补偿；如果双方均有过错，则按照双方的过错比例分担责任，也即给予被征收人一定补偿。
3、突击建造的房屋：不予补偿。
房屋征收范围确定之后，被征收人进行突击抢建以谋求更多的补偿，其本质是一种投机行为，是应该严厉打击、禁止的。对于这类建筑，在房屋征收中不应给予补偿。
对此，《征收条例》第16条也有明确规定，房屋征收范围确定后，不得在房屋征收范围内实施新建、扩建、改建房屋和改变房屋用途等不当增加补偿费用的行为；违反规定实施的，不予补偿。
（采晴整理）