房屋拆迁中存在的主要问题：
（一）被拆迁房屋的性质、面积认定困难：
一是住宅用房与附属设施界定难。这主要与农村房屋管理不规范有关。农村住宅用房与附属设施的区分，存在着是按房屋的使用性质还是按房屋的结构来划分的问题。房屋拆迁补偿安置是以房屋的性质、用途为依据来确定住宅用房或附属设施。
二是住宅与非住宅认定难。有的祖传房屋早期是住宅，后来一直用作经营商业或开办企业，但没有有效的非住宅产权证明；有的农民因生活需要将住宅用房自行改作经营用房，但未办理改变使用用途手续；也有的原来是企业厂房，后卖给农民作为居住用房，但未办理相关手续。在拆迁中，对这几类房屋，到底是按住宅补偿还是按非住宅补偿较难确定。
三是农村宅基地和房屋基础资料管理薄弱，导致被拆迁房屋的性质、面积认定困难。
（二）违章建筑成为农村房屋拆迁中的难点：
农村房屋拆迁涉及大量的违章建筑，使得拆迁工作难度增加。对这些违章建筑的认定主要困难在于建造时间的准确认定，往往建造时间越早，认定难度越大。按责任分，违章建筑分为四种：
一是搭建人不符合宅基地审批条件，建造前虽经村镇二级收费，但最终未获依法批准。
二是本村村民居住条件困难，且符合宅基地审批条件，但因用地指标及规划控制等原因未获批准而自行建造房屋。
三是因经济利益驱动搭建违章建筑，但政府有关职能部门未及时查处。
四是违章建筑因错误发证，或通过其他关系补办土地证及房产证，使其合法化。
（采晴整理）